Pro použití klecí je také nutné věnovat pozornost čištění, protože po dlouhé době, pokud nebudete věnovat pozornost čištění, bude to mít vliv na chov ryb a garnátů.
Při způsobu čištění klece je jedna metoda ruční čištění. Tato metoda se běžně používá pro sporadické klece. Síť se zvedá každých 5 dní a koště, větve, kartáče atd. Se vydrhnou a porazí. . Pak je metoda vystavení slunečnímu záření, tělo sítě je polovina vystavena vodní hladině, nechají svítit slunce a vláknité řasy a jiné organismy připojené k kleci jsou spáleny sluncem, přeměněny na druhou polovinu krabice nebo nahrazeny klecí více příloh. Na slunci, vystavte se slunci, připojte se k mrtvým tvorům a fackujte. Pak je zde metoda mechanického čištění. Při práci na velké ploše je klec zvednuta a propláchnuta vysokotlakou vodní pistolí pro odstranění nečistot z klece.
Existuje také metoda biologického odstranění. Ryby v krabici jsou smíchány s řasami, jako je chobotnice, tilapie a škorpion. Tato metoda nejen šetří práci, šetří peníze, ale také zvyšuje produkci ryb na jednotku plochy.
